鹽堿地的共性是有機質含量低，土壤理化性狀差，對作物生長有害的陰、陽離子多，土壤肥力低，作物不易促苗。

施用含菌肥料能提高土壤肥力，改善土壤結構，減少毛細管水運動的速度和水分的無效蒸發(fā)，有明顯的抑制返鹽效果。

還能增加土壤有效鈣的含量，同時微生物分解有機質產生的有機酸也能使土壤吸附的鈣活化，加強了對土壤吸附性鈉的置換作用，導致脫鹽脫堿。在微生物肥料及生物有機肥的作用下，鹽堿地的有害離子含量和pH值明顯降低，土壤緩沖性能增加，提高了作物的耐鹽堿性。

鹽堿地不易發(fā)苗，施肥總的原則是增施生物有機肥，適當控制化肥施用?；室嗍┯袡C質含量高的生物有機肥，減少化肥施用量，而化肥盡量不靠近種子，以免增加土壤溶液濃度，影響發(fā)芽。追肥根據(jù)情況，及時施入，避免過量。在有條件的地方，可以大量采用秸稈還田，種植耐鹽堿的綠肥等辦法，減少鹽堿對作物的危害。

粘土地施用含菌肥料的好處

粘土地一般含有機、無機膠體多，土壤保肥能力強，養(yǎng)分不易流失。但粘土供肥慢，施肥后見效也慢，這種土壤“發(fā)老苗不發(fā)小苗”，肥效緩而長，土壤緊實，通透性差，作物發(fā)根困難。這種土壤施用復合微生物肥料和生物有機肥，通過豐富的有機質和有益微生物的活動，改善土壤團粒結構，增加通透性，提高保肥保水能力。

粘土保肥能力強，化肥應與復合微生物肥料和生物有機肥配合施用。單獨施用化肥，若一次多施尤其是多施氮肥，因養(yǎng)分不易流失，后期肥效充分發(fā)揮出來，容易引起作物貪青晚熟，導致病蟲害發(fā)生和減產。

砂土地也能用含菌的肥料：

砂土地一般有機質、養(yǎng)分含量少，肥力較低，保肥能力差。但砂土供肥好，施肥后見效快，這種土壤“發(fā)小苗不發(fā)老苗”，肥效猛而短，沒有后勁。

砂土地要大量增施生物有機肥，提高土壤有機質含量，改善保肥能力。由于砂土通氣狀況好，土性暖，有機質容易分解，施用未完全腐熟的有機肥料或牛糞等冷性肥料受影響比粘土地要小。有條件的地區(qū)可種植耐瘠薄的綠肥，以改良土壤理化性狀。

砂土地施用化肥，一次量不能過多，否則容易引起“燒苗”或造成養(yǎng)分大量流失。所以砂土地施用化肥，必須與含菌類肥料和其他有機肥配合施用，而且要多次少量施用，即“少吃多餐”，以提高肥效，減少養(yǎng)分損失。 

含菌肥料中的有益微生物是這樣起作用的：

微生物進入土壤后，在生長繁殖過程中產生大量的次生代謝產物，這些產物能夠促進土壤團粒結構的形成。

團粒結構的形成使土壤變得疏松、綿軟，保水保肥性能增強，水、氣、熱更加協(xié)調，減少土壤板結，有利于保水、保肥、通氣和促進根系發(fā)展，為農作物提供舒適的生長環(huán)境。

土壤理化性狀的改善，加強了土壤有益微生物的活動，從而最大限度促使有機物分解轉化，產生多種營養(yǎng)物質和刺激性物質，反過來又刺激微生物的生長發(fā)育，促進作物生長，最終達到增產增收的目的。

另外，功能性微生物在作物根系周圍形成優(yōu)勢種群，抑制或拮抗有害病原菌的生長繁殖，減輕了作物發(fā)生病害的程度，進而起到增加產量的目的。